《夏与箱》是一部充满夏日气息的治愈奇幻漫画，讲述高三毕业的夏天，内向少女夏柚在整理祖母遗物时，发现了一只陈旧的木箱。箱子里装着七件祖母年轻时的物品：一把生锈的口琴、一叠泛黄的信件、一枚海螺吊坠、一张模糊的合影、一个空白的笔记本、一截干枯的薰衣草、一块停摆的怀表。每解开一件物品背后的故事，夏柚就会短暂地“穿越”回祖母的青春时代，见证她与一群挚友在那个夏天里关于梦想、离别与重逢的故事。而夏柚自己的人生，也在这个夏天因为这只木箱，与邻居少年、旧书店老板、以及祖母当年的闺蜜后代产生了奇妙的交集，她开始明白，每一个夏天都值得被铭记。
夏柚解开了最后一件物品——停摆的怀表，穿越回祖母弥留之际的病房。祖母握着她的手，微笑着说：“小柚，箱子里的夏天，是我留给你最好的成人礼。”怀表重新走动，夏柚回到现实，泪流满面地写完了祖母未写完的那封信。
夏柚触碰干枯的薰衣草，回到了祖母与初恋告别的那天。火车站台上，祖母将一束薰衣草塞给对方，轻声说“等待”。夏柚在现实中找到了那位老人——他终身未娶，在街角开了一家薰衣草花店。夏柚把祖母的信交给他，老人读完后，对着夏柚喊出了祖母的名字。
祖母的笔记本一片空白，夏柚穿越后发现这是祖母用来记录“未说出口的话”的日记本。她在笔记本上看到了祖母对闺蜜的愧疚、对家人的不舍、对自己的担忧。夏柚在现实中拿起笔，替祖母在每一页写下了当年没能说出的话，笔记本的字迹竟渐渐浮现。
夏柚穿越到祖母拍下那张合影的瞬间，那是五个少年少女在海边的约定——无论未来多远，每年夏天都要回到这里。她回到现实，凭借记忆找到了合影中其他四人的后代，把这张重新修复的合影交给了他们，一场跨越三代人的夏日聚会悄然筹备起来。
夏柚将海螺吊坠贴在耳边，听到了祖母与闺蜜的对话——两人曾因喜欢同一个男孩而冷战，最后在海边用这只海螺传递和好的悄悄话。夏柚找到祖母闺蜜的孙女，两人一起在海边复刻了当年那句“对不起”和“没关系”，海螺里传出了两声少女的笑声。
夏柚打开第一封信，那是祖母写给远行友人的告别信，但从未寄出。夏柚被拉入祖母的记忆中，看到了那年的毕业典礼，祖母躲在树后偷偷抹泪。她忍不住上前拥抱了年轻的祖母，祖母惊讶地回头，仿佛真的看到了她，轻声说：“你来了。”